מרכזי החדשנות המשותפים של קק"ל הם
מנועי צמיחה אזוריים המחברים בין אקדמיה, יזמות, תעשייה וקהילה. מטרתם ליצור פתרונות יישומיים חדשניים בתחומי הליבה של קק"ל שיהיו בעלי השפעה כלכלית, סביבתית וחברתית, ליצור הזדמנויות תעסוקה איכותיות בגליל ובנגב ולקדם פיתוח בר-קיימא.
המרכזים פועלים בשיתוף מוסדות אקדמיים מובילים ומעניקים לסטודנטים, יזמים ותושבי האזור כלים, הכשרות וליווי מקצועי לפיתוח מיזמים חדשניים בתחומי הטכנולוגיה, הסביבה והאקלים. לצד קידום יזמות ותעסוקה, המרכזים מחזקים את האקוסיסטם האזורי ומעודדים יצירת פתרונות לאתגרים מקומיים ולאומיים. כך הופכת החדשנות לכלי משמעותי בחיזוק הפריפריה, בצמיחת הכלכלה האזורית ובבניית עתיד מקיים עבור הדורות הבאים.
כיום קק"ל שותפה בארבעה מרכזי חדשנות בגליל ובנגב: