קק"ל פועלת להטמעת הקיימות כעקרון פעולה מנחה בכלל פעילויותיה, מתוך תפיסה הוליסטית הרואה בקיימות נקודת מפגש חיונית בין סביבה, חברה וכלכלה. קק"ל שואפת ליצור הלימה מלאה בין המהות הסביבתית של הארגון לבין אופן התנהלותו היום-יומי, במטרה לצמצם את החתימה הסביבתית של קק"ל ולהוות מודל לחיקוי. פעילות זו מקדמת התייעלות וחיסכון ארגוני, תפעולי וכלכלי, לצד אימוץ והטמעה של תקנים בינלאומיים ונוהלי עבודה מתקדמים בכלל יחידות הארגון.