יום לאחר חטיפת שני חיילי צה"ל (אלדד רגב ואהוד גולדווסר) בגבול ישראל לבנון והריגת שלושה חיילים נוספים, פתח צה"ל במתקפה רחבה נגד כוחות החיזבאללה שבדרום לבנון
ב-12 ביולי 2006, בשעה 09:00 בבוקר, תקפו לוחמי חיזבאללה סיור של צה"ל בגבול הצפון, הרגו שלושה חיילים, פצעו שניים וחטפו שניים – רס"ר אודי גולדווסר ז"ל ורס"ל אלדד רגב ז"ל. טנק שהוכנס ללבנון בניסיון לסכל את החטיפה עלה על מטען, וארבעת הלוחמים שהיו בו נהרגו. חייל בכוח החילוץ נהרג אף הוא. תקיפה זו לוותה בהפגזות רקטות ופצצות מרגמה מצד חיזבאללה על יישובי הצפון.
באותו לילה החליטה ממשלת ישראל לצאת למערכה צבאית, שב-25 במרץ 2007 הוגדרה כמלחמת לבנון השנייה. במשך 81 יום שהו כוחות צה"ל בלבנון (33 ימי לחימה ועוד 48 ימים מהפסקת האש ועד ליציאת הכוחות מלבנון).
במהלך המלחמה פלשו כוחות צה"ל לשטח לבנון ותקפו מהקרקע ומהאוויר את מוצבי חיזבאללה לאורך הגבול עם לבנון, פשטו קרקעית וביצעו מהלך קרקעי נרחב מדרום לליטני.
במהלך ימי הלחימה שיגר חיזבאללה אלפי רקטות לעבר מדינת ישראל. רקטות אלו פגעו בכל אזור הצפון מכרמיאל וחיפה במערב עד אזור טבריה במזרח, בית שאן ועפולה בדרום. מירי הרקטות נהרגו 44 אזרחים באופן ישיר ועקיף, בהם יהודים, ערבים ודרוזים, ו-12 חיילים. הרקטות גרמו לפגיעה חמורה ברכוש ולשריפות. כמו כן, גרם הירי לעזיבתם של רבים מתושבי הצפון את בתיהם, שהתארחו במרכז הארץ ובדרומה. החברה האזרחית הישראלית התגלתה במלוא חוסנה בתרומות, עזרה ואירוח משפחות מהצפון בתקופת המלחמה.
במהלך המלחמה נהרגו 166 בני אדם ורבים אחרים נפצעו. 121 מהם היו חיילים ו-45 אזרחים. יערות רבים נשרפו כתוצאה מנפילת טילים וקק"ל עסקה תקופה ארוכה בשיקומם.
הלחימה הסתיימה ב-14 באוגוסט 2006 בעקבות כניסתה לתוקף של הפסקת אש שהושגה בחסות האו"ם.
מלחמת לבנון השנייה נתפשה בקרב הציבור הישראלי ככישלון. כוחו ועוצמתו של חיזבאללה בגבול ישראל הצפוני הוכחו. נמתחה ביקורת קשה על הדרג המדיני ועל הפיקוד הצבאי הבכיר על המוכנות למלחמה ודרך חיילי צה"ל בגבול הצפון. צילום: ארכיון הצילומים של קק"לניהולה. מחאה ציבורית גרמה להתפטרותם של שר הביטחון עמיר פרץ, הרמטכ"ל דן חלוץ וקצינים בכירים בצה"ל, בהם אלוף פיקוד הצפון אודי אדם. למרות הביקורת על הדרג המדיני וקריאות שנשמעו, אהוד אולמרט, ראש הממשלה דאז, לא התפטר.
ועדת וינוגרד, ועדת בדיקה ממשלתית בראשותו של השופט בדימוס אליהו וינוגרד, הוקמה לבדיקת המלחמה והגישה את הדוח הסופי שלה בסוף ינואר 2007. ועדת וינוגרד ציינה כי לצד היכולות המרשימות שהפגינו חיל האוויר והמודיעין, התגלו כשלים חמורים הן בתחום הצבאי והן בתחום הממשלתי. הוועדה הגישה שורת המלצות ארוכה בכל אחד מהתחומים שסקרה.