פעילות החוגים מתבצעת בדומה לפעילות תנועות הנוער, במפגשים שבועיים של מדריך עם קבוצתו. בנוסף לפגישות השבועיות מתקיימים טיולי סוף שבוע אחת לחודש וארבעה מחנות שנתיים בני מספר ימים. כלל הפעילות מתקיימת בקבוצות של 15-10 חניכים בליווי מדריך.
המדריכים בחוגים הם מהמקצועיים בארץ בתחומם ועוברים קורסים והכשרות כל השנה. פעילות חוגי הסיירות משמרת בתוכה סגנון חינוך וטיול שאינו קיים במסגרות אחרות בישראל, החניכים לנים תמיד תחת כיפת השמיים, ללא אוהלים, מבשלים את מזונם על גבי מדורות והם שותפים פעילים למהלך הטיול ולתכנון של תכניו ומסלולו.