ההתיישבות היהודית בשוני החלה ב-1912, עם רכישת האדמות על ידי חברת יק"א, והמשיכה בהתיישבות "חומה ומגדל" בתל צור ב-1939. לאחר מכן שימש האתר בסיס אימונים ויציאה לפעולות האצ"ל.
שנים רבות עמד האתר מוזנח, עד שבשנת 1986 קיבלה על עצמה קרן קימת לישראל את שיקום המבנה וחיזוקו והפכה אותו לאתר לאומי במרכזו של פארק לזכר זאב ז'בוטינסקי.הקבוצות ביקרו במוזיאון הארכיאולוגי הנמצא בשוני, קיבלו הסברים על הממצאים המיוחדים שנמצאו בחפירות במקום, וראו את המוצגים, בהם: חפצי נוי, מטבעות, פסל של האל נפטון-פוסיידון (אל הימים והאגמים המתחבר לפולחן המים באתר), פסלון חזיר מברונזה ועוד.