מחניון הלילה של קק"ל נצעד לכביש 98, נפנה מזרחה ולאחר כ-300 מ' נגלה כמה עצי איקליפטוס ומכלאת בקר קטנה. סמוך אליהם ניצב השלט הירוק המכריז על שמורת נחל מיצר. לפני שנרד לנחל, נעיף מבט מסביב.
המדרונות מכוסים ביער נהדר של אלון התבור. העץ הזה מותאם היטב לקיץ החם השורר כאן ולסוג המסלע. עץ חשוב נוסף שצומח כאן הוא האלה האטלנטית, המעדיפה את אזורי המצוקים, משום שבין הסלעים מתקיים משק מים משופר.
שמורת נחל מיצר היא ביתו של השקד קטן העלים. זהו שיח המאפיין את אזור הספר של החבל הים התיכוני. השקד ניכר בקצות ענפיו הקוצניים ובעליו הבהירים יחסית. גם השקד, כמו אלון התבור, משיר את עליו בחורף. עץ קטן נשיר-חורף אחר הוא העוזרר הקוצני, המצמיח באביב פירות כדוריים וטעימים. מזהים אותו על פי ענפיו הקוצניים ועליו בעלי המפרצים העמוקים. אליהם מצטרף גם הלבנה הרפואי, עץ עדין הניכר בעליו הרכים, הבהירים בצדם התחתון.
מין שיח אחר שנפגוש בו במהלך המסלול הוא שיזף השיח. זהו שיח קוצני, בעל ענפים דקים, לבנים ומעוקמים. הפירות אינם אכילים, בניגוד לקרובו הגדול ממנו – שיזף מצוי. צמח מעניין במיוחד שגדל כאן הוא רותם המדבר, הניכר בענפיו השרביטיים המחוסרים עלים רוב השנה, שמתכסה בפברואר בשפע של פריחה לבנה וריחנית. הרותם מאפיין את האזורים המדבריים של ארצנו ושל הסהרה. הוא חודר לדרום הגולן מהמדבר דרך בקעת הירדן.