לאורך נחל השופט התגלו ממצאים המעידים על התיישבות אדם בימי קדם. בתל פרור, שנמצא במעלה נחל השופט, נמצאו שרידי התיישבות לפחות למן התקופה הניאוליתית (לפני כ-10,000 שנה). אוסביוס, בישוף קיסריה במאה הרביעית לספירה, מזכיר יישוב בשם אפאריה במרחק שישה מיל מצפון ללגיו (מגידו) וייתכן מאוד שכוונתו ליישוב ששכן בתל פרור.
השביל הנגיש נמצא בצל הגבעה הגדולה של תל קירה. גם כאן, בצד הצפוני של הגבעה, וליד נחל סנין, התגלו שרידי יישובים שהתקיימו מתקופות פרהיסטוריות עד לתקופה הרומית. התושבים לדורותיהם ניצלו את הסלע הרך של התל לחציבת מערות ששימשו, בין השאר, אחוזות קבר, בורות מים, מקומות אכסון לבעלי חיים, למגורים ולשימושים נוספים. חלק מהמערות, שימשו את תושבי הכפר הקטן קירה גם במאה ה-20.
בנחל פעלו בעבר שלוש טחנות קמח. מהעליונה שבהן, למרגלות מושב עין העמק, נותרו שרידים מעטים. מבני הטחנה שבצד השביל הנגיש וזו שנמצאת בתחום קיבוץ הזורע נותרו במצב טוב בהרבה.